根据中共苏州市委批准的市政协机关机构改革方案，市政协机关设办公室、研究室、委员服务联络工作办公室，8个专门委员会。

1. 市政协办公室

内设6个职能科室：秘书科、人事科、老干部工作科、行政科、接待科、信息科。

办公室下属事业单位：市政协委员活动中心。

另设：机关党委（机关纪委）。 

2. 市政协研究室

内设2个职能科室：综合科、学习宣传科。

3. 市政协委员服务联络工作办公室

内设职能科室：综合科。

4. 市政协8个专门委员会及秘书科

提案委员会、经济和农业农村委员会、教卫体委员会、社会法制委员会、人口资源环境委员会、港澳台侨外事委员会、民族宗教委员会、文化文史委员会。其中，港澳台侨外事委员会、民族宗教委员会合署办公。各专门委员会下设秘书科。